Kotkan Meripäivät tuo muutoksia jäteastioiden tyhjennyspäiviin Kotkansaarella. Tapahtuman vuoksi keskustassa on ajokieltoja, jotka koskevat myös jäteautoja. Kotkansaaren kotitalouksien jäteastioita ei siis pystytä tyhjentämään normaalisti Meripäivien aikana.
Loppuviikosta tyhjennysvuorossa olevia keskustan jäteastioita tyhjennetään etukäteen, aiemmin samalla viikolla. Jäteastian tyhjennyspäivä voi siirtyä päivän verran totuttua aiemmaksi tai myöhemmäksi myös muualla Kotkassa meripäiväviikon aikana.
Jätteenkuljetuksissa saattaa lisäksi olla viivästyksiä Meripäivien jälkeisellä viikolla (viikko 31). Kuljetuksia kuormittavat silloin etenkin keskustaan kertyneet, normaalia suuremmat jätemäärät.
Jäteastioiden meripäivä-ähkyä voi helpottaa lajittelemalla ahkerasti, käyttämällä ekopisteitä ja pakkaamalla jätteet tiiviisti.